《大漢天子3》主要講述的是進入中年的漢武帝和漢室新一代楝梁之間的故事。繼第二部《漢武雄風》故事之后，又過了十六年。步入中年的漢武帝劉徹，稱帝二十余年，驅伊稚部落于漠北，削諸藩而一統，富國強兵，使大漢王朝進入了輝煌鼎盛時期。永不滿足的漢武帝，不斷設計自己的人生藍圖。他聯合西域，穩定北疆，再無后顧之憂；又將目光轉向南越（今兩廣、西南）。意在建成最強大的大漢王朝，自己也要繼三皇五帝之后，成為有史以來不朽的“六帝”。漢武帝痛感到光陰催人，理想遠大而天不永年。戰線過長而臂助短缺.霍去病、衛青等大將先后凋謝，主父偃、汲黯等才臣也紛紛下世。漢武帝大膽起用年青一代——桑弘羊胸有成竹而不動聲色，他將鹽鐵收為官營，堅實了大漢的財源；王印鋒芒畢露，獨騎闖夜郎國，使“夜郎自大”的國王歸順漢朝，穩定西南；當年長城邊賣“羊肉梢子面”的老板兒子卜式，已成為關內最大的牧場主，慷慨捐資，毀家紓國；歸順漢朝的渾協王之子金童力馴劣馬，為漢武帝識拔，任為軍馬總監，為之平息叛亂，屢立奇功……