故事發生在1574年日本戰國時代，在一座名為“春日”的小國中，一位名叫“井尻又兵衛”(草剪剛飾)的武將，受命保護著 本國的公主“阿廉”(新垣結衣飾)。武將與公主從小在一起長大，雖然身份與地位不同，但二人情投意合、彼此相戀，演繹了一段感人至深 的“悲戀”。某一天，“又兵衛”在戰爭中受了重傷，甚至快要死去，就在這時，一個名叫“井上真一”　(原作中的“小新”/武井證飾)的 小男孩穿越時空，突然出現在他的面前，并且陰差陽錯地救了他的性命，小男孩更因此得以見到了夢中的那位美女“阿廉公主”…
　　此部的結局不同于其他劇場版，是以悲劇收場。惡搞和搞笑場景也不如其他劇場版多，全片稍偏向嚴肅。