問題兒童都來自異世界故事講述的是對世界已經厭煩的逆回十六夜在某一天收到了一封邀請函。當他看清邀請函中寫著的內容：“望你舍棄一切，前來「箱庭」”的瞬間──他來到了完美無缺的異世界。出現在十六夜眼前是帶著貓的沉默少女與態度高傲的大小姐，還有召喚他們三人來到異世界的罪魁禍首——黑兔。當黑兔正在為他們說明箱庭世界的規則時，十六夜卻突然表示：“來打倒魔王吧！”。可是黑兔沒有拜托他們做那樣的事情，三個超級問題兒和黑兔的明天最終將會前往何方？這部既充滿著幻想元素又時時令人捧腹大笑的故事就此開始了。