加利福尼亞西北部有一座平靜安詳的小城，毗鄰北太平洋，木材業、捕魚業和旅游業是其經濟的重要來源。人口僅有2萬余人。但不為人知的是，這個小城隱藏著一個巨大的秘密：政府多年前就把世界上最聰明的一些天才及他們的家屬安排到這個每天都在改革和混亂中搖擺動蕩的小鎮定居。聯邦司法長官Jack Carter在一次執行任務中，車子意外在小城拋錨，困在當地進退兩難。但是，古里古怪的小城很快讓他倍感疑惑。當地那些行為怪異的居民釋放出了對這個世界來說還是未知之數的科學產物，產生了巨大恐慌。Carter試圖恢復當地的秩序，并逐漸了解了這個小城背后所掩蓋的驚天秘密，這個秘密多年來一直是美國政府竭力掩蓋的最大秘密…… 　　從發自內心的熱愛到怨恨嫉妒，從沉溺上癮到悲傷消沉，小城尤里卡的居民們在日復一日的生活積累中逐漸產生了越來越多的問題。雖然單個問題并不足為奇，但是伴隨著這些居民獨特的天才、有病的心理狀態和十分有限的資源，這些小問題逐漸演變成不可收拾的大問題。《小城疑云》的故事起始于一個十字路口式的博奕，在這里，人類的意志和科學帶來的超級變革發生碰撞、發生抵觸。